La fragmentación del hábitat, asociada al avance de la frontera agropecuaria y al incremento de la red vial, afecta la fauna silvestre. En Argentina los avistajes de aguará guazú (Chrysocyon brachyurus) en cercanías a áreas pobladas son cada vez más frecuentes y los atropellamientos en rutas fueron citados como una de sus principales amenazas. A su vez, el uso de ambientes antropizados aumenta el contacto con animales domésticos incrementando el riesgo de transmisión de patógenos. En Santa Fe, luego de la puesta en marcha del “Plan de acción para la conservación del aguará guazú”, iniciado en 2009, comenzaron a incrementarse significativamente los reportes de aguará guazú en áreas urbanas y periurbanas, así como también los atropellamientos. Esto coincide con el registro de ejemplares por fuera del área de distribución geográfica conocida. En el marco del Plan, entre 2014 y 2020 se rescataron 60 individuos, de los cuales un 62 % se liberaron (in situ y/o luego de rehabilitación en la Estación de Rescate, Rehabilitación y Reubicación de Fauna “La Esmeralda ̈ (EZE), un 20% murieron, mientras que un 18% aún permanece bajo cuidado humano en la EZE. En el marco de este proyecto se colectan muestras biológicas (sangre, heces) de los ejemplares y se realizan necropsias de los animales hallados atropellados. Las muestras se analizan mediante técnicas moleculares (PCR) para la detección de parvovirus canino y distemper canino. Los rescates y atropellamientos en Santa Fe hasta la fecha han mostrado tendencias en aumento, de norte a sur provincial, a medida disminuye la idoneidad ambiental para la especie. Mediante el programa SatScan, analizamos la agregación de atropellamientos a nivel país, detectándose un cluster en la ecorregión del espinal santafecino, en cercanías a la localidad de San Cristóbal, que podría corresponder con un “hot-spot”. Los resultados obtenidos proveen nuevas herramientas para el desarrollo de estrategias de manejo de la especie y sus hábitats, en torno a dos reconocidas amenazas: los atropellamientos y las enfermedades.